FlexS

Lýsing

FlexS spáir fyrir um lögun og stefnu annars bindilanna miðað við hinn. Í FlexS er gert ráð fyrir að viðmiðunarbindillinn sé stífur, þannig að hann ætti að vera gefinn í sköpulag sem er svipað og bundið ástand. Yfirsetningaralgrímið í FlexS krefst aðeins lítillar handvirkrar inngrips. Þú getur samþætt þessa þekkingu inn í útreikninga með FlexS með því að framkvæma stök skref handvirkt. Þannig er FlexS hannað fyrir gagnvirka vinnu á bindilapörum sem og fyrir bindlabyggða sýndarskimun. Tvö helstu forrit FlexS eru bindill super staðsetning (td fyrir CoMFA/QSAR) og sýndarskimun. Ef þú ert með prótein og litla sameind sem bindast því (svokallað tilvísunarbindill) en enga byggingu próteinsins, geturðu tekið tilvísunarbygginguna sem neikvætt fingrafar af virka staðnum. FlexS ákvarðar líkindin á milli prófsins og viðmiðunarbyggingarinnar með því að samræma þau. Í sýndarskimun ertu með viðmiðunarbindil og mengi efnasambanda og þú hefur áhuga á að forgangsraða efnasamböndunum fyrir tilraunaprófanir.