CodonCode Aligner

Lýsing

CodonCode Aligner er notendavænn hugbúnaður fyrir samsetningu DNA raða, röðun, samfelldum breytingum og stökkbreytingagreiningu. Aligner er samhæft við Phred-Phrap og styður að fullu röð gæðastiga, en býður upp á kunnuglegt notendaviðmót sem auðvelt er að læra. Eiginleikar fela í sér að flytja inn raðir úr textaskrám, samræma samsetningar við hvert annað en halda tenglunum við ummerkin, finna arfblendnar stökkbreytingar, skilgreina áhugasvæði ("eiginleika"), flytja inn og breyta Phrap-mynduðum samsetningum, flytja út raðir og eiginleika, flytja inn raðir úr ABI og SCF skrám, vektorklippa, stilla saman við viðmiðunarröð, greina arfblendnar innsetningar og eyðingar, fletta á milli notendaskilgreindra eiginleika og flytja út Consed-samhæf samsetningarverkefni.